康复医学科是集康复医疗、预防保健、科研教学为一体的综合性科室。科室注重疾病的预防、治疗和康复相结合，提倡“早诊断、早治疗、早康复”的理念，强调超早期康复介入及全面康复的宗旨,并开展各种疾病及功能障碍的康复治疗。
　　科室设有门诊、住院部、康复大厅，现康复治疗室训练场地面积有400余平方，引进国内外各种先进康复设备，经颅磁刺激治疗仪、天轨步态系统、智能康复训练系统、三维动作捕捉分析系统、上肢康复机器人、冲击波治疗仪、悬吊治疗、生物智能反馈训练及必备的理疗与运动训练器材。目前，开展成人康复和儿童康复，拥有运动治疗室、作业治疗室、言语治疗室、物理因子与传统康复治疗室。可对脑卒中、颅脑损伤、截瘫、各种神经损伤、骨关节创伤、儿童脑瘫、产后及盆底损伤、运动损伤、老年慢性疾病及手外伤治疗术后进行康复评定、训练及治疗。
　　科室现承担菏泽医专、菏泽家政职业学院、单县卫校等临床实习带教工作，现有8名康复医师治疗师，曾在北京、中山、青岛培训学习，并有工作者担任省市级康复相关学术会议委员等。
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